Я не знаю, можно ли обобщить мой опыт, но у меня была доля проблем с анализом SOAP-сообщений с помощью jQuery. Это, вероятно, не относится к jQuery (как вы указали в документации, это не рекомендуется).
Во всяком случае, вы спросили об особенностях: я обнаружил, что все с пространствами имен проблематично. Конечно, для подлинного понимания пространства имен вам понадобится что-то, что может разрешить префиксы пространства имен в URI пространства имен. Я никогда не ожидал, что jQuery сможет это сделать, но даже сопоставление только префиксов не сработало для меня. Это особенно проблематично для меня, потому что сообщения SOAP, с которыми я имею дело, легко смешивают 4 или 5 пространств имен. Поэтому я вернулся к выполнению обхода DOM для решения этой проблемы (которая имеет свой собственный набор проблем)
Тем не менее, я ожидаю, что jQuery сможет обрабатывать документы xhtml (если имена тегов не имеют префикса), и я ожидаю, что он будет работать и для других документов xml, которые не используют префиксы пространства имен.