Невозможно получить доступ к отдельным контактам на порту VGA.
Проблема в том, что видеокарта полностью абстрагирует ее (без утечек), поэтому нет способа обойти ее, даже на уровне ядра.
Я бы в любом случае не рекомендовал бы использовать порт VGA в качестве порта данных.