Обычные файлы javascript могут кэшироваться на стороне клиента, если веб-сервер устанавливает срок действия. Если пользователь однажды скачал его, он будет кэширован его браузером.
А как насчет AjaxControlToolkit ToolkitScriptManager? Кэшируются ли на клиенте комбинированные JS-файлы? Как можно управлять сроком годности?