EXE проверяет, присутствует ли установщик Windows 3.0, загружает и устанавливает его, если его нет. Это нужно только для Windows 2000 или старше. Windows XP и новее имеют Windows Installer 3.0 из коробки.
Другие предварительные условия, такие как .NET, проверяются самим MSI.