У меня была такая же проблема после введения геометрии Sql Type в проект БД (в моем случае для версии проекта БД было установлено значение "2005", когда я сравнивал схему SQL 2008)
Я решил проблему, изменив версию проекта базы данных (Свойства -> Настройки проекта -> Версия проекта) на 2008.
После этого, когда вы щелкнете правой кнопкой мыши по ссылке (для проекта базы данных) или по самому проекту, вы увидите опцию «Добавить типы CLR SQL Server 2008». Это добавит нужную ссылку и решит проблему.
Вот что для меня добавление ссылки, сгенерированной в proj XML:
<ItemGroup>
<ArtifactReference Include="$(VSTSDBDirectory)\Extensions\SqlServer\2008\DBSchemas\Microsoft.SqlTypes.dbschema">
<HintPath>..\..\..\..\..\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 9.0\VSTSDB\Extensions\SqlServer\2008\DBSchemas\Microsoft.SqlTypes.dbschema</HintPath>
</ArtifactReference>
</ItemGroup>