В соответствии с политикой, установленной Apple для приложений для iPhone, вы не можете использовать какой-либо интерпретируемый язык. Таким образом, Javascript, к сожалению, не может быть и речи.
Это указано в соглашении iPhone SDK.
3.3.2 - Приложение не может само установить или запустить другой исполняемый файл
код любым способом, в том числе без
ограничение за счет использования
архитектура плагинов, вызывая другие
фреймворки, другие API или иным образом.
Не может быть загружен интерпретированный код
или используется в приложении, за исключением
код, который интерпретируется и выполняется
Документированные API Apple и встроенные
переводчик (с).