Это не быстрый и простой ответ, я рекомендую прочитать следующие ссылки CodePlex для Руководства по безопасности WCF:
Безопасность WCF & Руководство по безопасности WCF .
Сайт предоставляет пошаговые контрольные списки для различных сценариев, один из которых вы должны иметь возможность соотнести с вашим сценарием. Для сценариев интрасети и Интернета предусмотрены различные сценарии и настройки безопасности с механизмами аутентификации, включая: Нет, Базовый, NTLM, Windows, Сертификаты, Имя пользователя, Токены. Варианты авторизации включают: на основе роли, на основе идентификации и на основе ресурсов. (см. Главу 5)