Если я правильно помню, новый проект Flex по умолчанию содержит папку libs, которая является предпочтительным способом управления SWC в вашем проекте. Просто поместите SWC-файл Facebook в папку libs, и он будет скомпилирован с вашим проектом.
Вы можете управлять библиотеками, скомпилированными с вашим проектом Flex, щелкнув правой кнопкой мыши папку проекта в Flash Builder и выбрав «Свойства», «Путь сборки Flex» в левой части и, наконец, вкладку «Путь к библиотеке». Папка libs уже должна быть элементом в этом списке, но вы можете добавить ее, если ее нет, или просто добавить отдельный SWC-файл.