Это довольно просто сделать с помощью файла MSBUILD.
Вот пример цели, которая перестроит все ваше решение и развернет ваше веб-приложение MVC в желаемом выходном каталоге
<Target Name="Deploy">
<MSBuild Projects="Solution.sln" Targets="Rebuild" />
<MSBuild Projects="MVCWebProject\MVCWeb.csproj"
Targets="ResolveReferences;_CopyWebApplication"
Properties="OutDir=$(OutputFolder)\bin\;WebProjectOutputDir=$(OutputFolder)" />
</Target>
В вашей конфигурации cc.net просто передайте параметр / p задаче MSBUILD, чтобы указать каталог вывода для вашего веб-приложения следующим образом:
/ р: OutputFolder = C: \ Your \ Output \ Путь