Как говорит stagas, вы можете использовать модуль, который управляет связью, если вы хотите использовать внешнюю базу данных.
Если вам нужна внутренняя (= встроенная) база данных, вы можете использовать такую, написанную на javascript, которая вам может потребоваться, как любой другой модуль, такой как NeDB или nStore . Они проще в использовании и полезны, если вашему веб-приложению не нужно обрабатывать много одновременных подключений (например, инструмент, который вы создаете для себя или небольшой команды), или если вы пишете настольное приложение с использованием Node Webkit