Apple не важно, на каком программном обеспечении работает ваш сервер. Пока клиентское приложение iPhone соответствует их правилам, с вами все будет в порядке.
Я не уверен, какое приложение вы пишете, но рассмотрим некоторые из приложений в магазине: приложения для обмена мгновенными сообщениями, которые взаимодействуют с IRC, AIM, Facebook, Twitter и т. Д. Эти серверы почти наверняка не Mac. .