У нас был сайт, который поразил 350 000 файлов изображений в одном каталоге. Сайт работает очень хорошо, обслуживая эти изображения. Проблема возникает, когда вы пытаетесь просмотреть этот каталог в проводнике. Проводник заинтересован поделиться с вами больше, чем именем файла; он хочет показать вам значок и другие свойства, такие как размер изображения, которые он должен получить, прочитав сам файл.
Подпапки удобнее для администраторов, которым приходится управлять этими ресурсами.
Возможно, вы захотите установить пороговый параметр количества файлов, начиная с 10 КБ для каждой папки, и настроить его в зависимости от того, насколько хорошо в этой папке можно перемещаться в Проводнике.