Хороший вопрос, я подозреваю, что они остаются библиотеками динамических ссылок с разными расширениями файлов, но я могу ошибаться. Расширение файла, в конце концов, не гарантирует тип файла. Еслиses.exe в Windows SDK может их проанализировать, это dll. Я никогда не пробовал и теперь не могу, на моем компьютере больше нет Windows.
Редактировать: глядя на это: http://httpd.apache.org/docs/2.0/mod/mod_so.html#creating похоже, это просто соглашение об именах - "Apache все еще загружает .dlls ..."