Я вижу, вы используете Visual Studio, так что, возможно, это связано с кодировкой файлов? У меня были странные проблемы с исходными файлами кодирования VS по-разному на двух разных машинах, хотя машины имеют одинаковые настройки языка и культуры. В VS источники выглядят точно так же, но SVN видит необработанные файлы ...
Откройте две ревизии в редакторе, который ничего не знает о Unicode или кодировке (я думаю, что использовал Notepad?), И посмотрите, отличаются ли они. Первая строка файла содержит код, который указывает, какой тип кодировки используется. Я понятия не имею, как интерпретировать этот код, но, по крайней мере, вы сможете определить, отличаются ли они.
В меню Сервис -> Параметры -> Среда -> Документы, управляющие кодировкой, есть параметры.