Есть много способов решить это. Перечислено от лучшего к худшему
1) Используйте движок шаблонов и держите php и html отдельно. Кроме того, используйте ненавязчивый JavaScript и избегайте кода JavaScript в HTML-тегах
2) При выводе сложного html выйдите из режима php и напечатайте строки как есть.
function foo() { ?>
some complex html
<?php
php continues here
} // foo
3) Используйте синтаксис heredoc, чтобы избежать проблем с цитированием
$output .= <<<TEXT
<img style="outline:none;" src="sites/default/unselect.png" alt="Unselect All" onclick='$(this).siblings('.form-item').each(function(index){ $('input:checkbox', this).attr('checked', ''); });'/>
TEXT;
4) Избегайте кавычек, как говорили другие