Я использую MongoDB для хранения, но начальный размер БД составляет около 50 МБ (даже с --smallfiles, переданными серверу при запуске).
Как я могу начать с гораздо меньшего размера БД (максимум 1 МБ)?
Почему это проблема? У вас есть много баз данных? Разве вы не можете использовать несколько коллекций вместо нескольких баз данных.
Но есть также опция командной строки --nssize (см. http://www.mongodb.org/display/DOCS/Command+Line+Parameters). Вы пробовали это?