Поместите их оба в окружающий vbox (если вы хотите сложить их вертикально, то есть):
parentVbox = gtk_vbox_new(FALSE, 0);
vbox = gtk_vbox_new(FALSE, 0);
gtk_box_pack_start(GTK_BOX(parentVbox), vbox, TRUE, TRUE, 0);
...
frame = gtk_fixed_new();
gtk_box_pack_start(GTK_BOX(parentVbox), frame, TRUE, 0);
...
gtk_container_add(GTK_CONTAINER(window), parentVbox);