Используйте NotificationManager для отмены вашего уведомления. Вам нужно только указать свой идентификатор уведомления.
https://developer.android.com/reference/android/app/NotificationManager.html
private static final int MY_NOTIFICATION_ID= 1234;
String ns = Context.NOTIFICATION_SERVICE;
NotificationManager mNotificationManager;
mNotificationManager = (NotificationManager) getSystemService(ns);
mNotificationManager.notify(MY_NOTIFICATION_ID, notification);
Пример кода не завершен. Это зависит от того, как вы создали ваше уведомление.
Просто убедитесь, что вы используете тот же идентификатор, чтобы отменить свое уведомление, которое вы использовали при создании уведомления.
Для отмены:
mNotificationManager.cancel(MY_NOTIFICATION_ID);