В Eclipse при настройке внешнего инструмента («Пуск» -> «Внешние инструменты» -> «Конфигурации внешних инструментов»), в частности, Ant Build, на вкладке «Главная» есть флажок «Установить обработчик ввода». Это проверено по умолчанию.
Что это делает? Когда вы захотите снять отметку и какие будут преимущества?