Вы не указали какую платформу, поэтому я отвечу на этот вопрос для WPF, в которой это определенно возможно.
Вы можете использовать метод OverrideMetadata в CheckBox.IsCheckedProperty для предоставления значения по умолчанию "true" для всех CheckBoxes. Добавьте этот код в свой класс приложения (в App.xaml.cs):
protected override void OnStartup(StartupEventArgs e)
{
base.OnStartup(e);
CheckBox.IsCheckedProperty.OverrideMetadata(typeof(CheckBox),
new FrameworkPropertyMetadata(true));
}