Поскольку MKPinAnnotationView
является подклассом UIView
Я считаю, что вы можете явно установить его фрейм.
В качестве альтернативы вы можете применить CGAffineTransform к вашему виду, чтобы масштабировать его соответствующим образом.
pinView.transform = CGAffineTransformMakeScale(2.0, 2.0);