Сравниваете ли вы рендеринг в IE и другом браузере, переключаясь назад и вперед? Если это так, вы можете заметить сдвиг из-за полосы прокрутки. IE резервирует место для полосы прокрутки, в то время как браузеры, такие как Firefox, показывают прокрутку окна только при необходимости.