Нет, это не сработает. CLR проверит номер версии сборки, ожидая получить тот, с которым была скомпилирована ваша основная программа. Вам придется использовать элемент <bindingRedirect> в файле app.config, чтобы убедить его в том, что с другой версией все в порядке.
Это скользкий склон. Измените атрибут [AssemblyVersion] только в том случае, если изменился открытый интерфейс сборки и требуется перекомпиляция клиентов. Теперь вы получите исключение, которое идентифицирует реальную проблему. Это еще один вид скользкого склона, но у вас будет гораздо больше контроля.
Для сравнения, так работают все базовые сборки в .NET Framework. Между .NET 2.0 RTM и 3.5 SP1 было много версий, включая множество невидимых исправлений. Но [AssemblyVersion] по-прежнему 2.0.0.0, Microsoft только изменяет [AssemblyFileVersion].