Вы должны перефразировать свой вопрос. Файлы RPGLE не существуют в iSeries. Все является таблицей DB2 (которую можно использовать с использованием RPGLE).
Если у вас JTOpen400, то я советую использовать JDBC. С JDBC iSeries является обычным сервером баз данных DB2. Он работает как любой другой сервер базы данных. Просто следуйте рекомендациям JDBC, как описано во многих книгах, руководствах и на веб-сайтах.