В документах matplotlib представлен целый раздел примеров по анимации (см. Также руководство scipy ) Большинство, однако, связано с использованием различных графических интерфейсов виджетов. Там есть одна, «демонстрация фильма», которая показывает, как создать AVI из серии PNGS.
Для создания анимированных GIF-файлов, я думаю, ваши варианты довольно ограничены . В последний раз я проверял, PIL не поддерживал их . Однако вы можете сгенерировать серию PNG с помощью savefig в pyplot, а затем соединить их вместе с помощью вызова ImageMagick или mencoder.