Drupal в целом относительно безопасен, но уязвимости появляются регулярно, как и в любом веб-приложении. Обязательно следите за рекомендациями по безопасности и реагируйте на любые недостатки, о которых там сообщается, для используемых вами основных и дополнительных модулей (вы можете получить их по почте, подписавшись на рассылку новостей на страницах вашей учетной записи Drupal.org). *
Что касается cron.php, установка Drupal по умолчанию не защищает его от прямого вызова кем-либо, таким образом подвергая некоторому риску DOS, но вы можете довольно легко защитить его, ограничив доступ к нему через правила .htaccess - см. http://drupal.org/node/41049 для обсуждения (не волнуйтесь, cron.php не предоставит никаких данных).