Обычно вы не компилируете файлы заголовков (.h), а вместо этого .c файлы.
Если у вас просто есть пакет с исходным кодом, который использует автоинструменты и вы хотите скомпилировать обычную команду, будет:
./configure && make
Если вы также хотите установить пакет в вашей системе, следуйте указаниям make install.