У меня та же проблема, что и описанный девиз. Локальные переменные не отображаются при отладке, метод hover тоже не работает. Вы всегда можете использовать trace()
или Loging API.
Проблема возникла у меня вчера, и единственное, что я заметил, это то, что проект перестал компилироваться с использованием ant-скрипта из-за OutOfMemoryError (я обычно собираю проект с использованием FB, но иногда FlexBuilder не показывает ошибки / предупреждения, а компиляция с помощью ant-скрипта единственный способ, которым я знаю, чтобы найти их).