Из изображений видно, что SWF-файл отображается в браузере каждого сервера - один хороший и один плохой. Не то, как SWF отображается в любом браузере при размещении на каждом сервере.
Смысл в том, что дисплей браузера работает неправильно. Я бы предположил, что это проблема рендеринга с браузером, а не с сервером.
1.) Проблема может быть вызвана отключением JavaScript в одном из браузеров и просмотром из тега embed. Убедитесь, что при включенном и выключенном JavaScript он выглядит одинаково.
2.) Высота, равная 100%, также может испортить его в браузере. Попробуйте установить высоту на определенное значение (800 пикселей) и посмотрите, исправит ли это проблему.
3.) Убедитесь, что браузеры одинаковы. Один IE 7 и один IE 8? Если они совпадают, проверьте номер версии, чтобы убедиться, что все обновления одинаковы для каждого.
4.) Просмотр сайта с другого компьютера, подключенного к серверу.
Номер 1 и 2 - моя лучшая догадка как способ устранения неполадок.