Все, что вам обычно нужно сделать, это настроить привязку для использования безопасности транспорта, а затем настроить IIS для SSL. Это предполагает, что вы используете стандартную привязку WCF и размещены в IIS.
Вы можете погуглить "безопасность транспорта wcf" или просмотреть основную статью MSDN: http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms733043.aspx
Существует также тема StackOverflow 425978 / enable-ssl-for-my-wcf-service , в которой показан фрагмент конфигурации XML.
Если есть более конкретная проблема, то я могу попытаться помочь в дальнейшем ... Пользовательские привязки или самостоятельное размещение требуют немного больше работы.