После изменения файла freetds.conf нужно ли что-нибудь перезапускать, чтобы увидеть изменения в выполнении запросов ODBC из PHP?
Из большинства разновидностей Linux вы можете использовать FreeTDS, которая содержит утилиту FreeBCP. http://www.freetds.org/ Он работает в основном как родной для SQL Server bcp.exe