Вероятно, это сочетание значения axID и проблем округления. Идентификатор оси, скорее всего, запрашивает целочисленное значение, и вы можете указывать одинарное / двойное. Таким образом, кэшированные данные в chart1.xml не знают, как отображать.
Попробуйте выполнить те же манипуляции, что и вы, но вместо того, чтобы открывать результат в PowerPoint, измените расширение .pptx на .zip, распакуйте, а затем вручную исправьте ошибки округления в соответствии с исходным округлением. Затем архивируйте обратно, измените расширение на .pptx и откройте в PowerPoint. Если это устраняет проблему отображения, вы можете подтвердить, что это проблема округления.
В качестве альтернативы и в том же духе. Откройте получившийся PPTX в PowerPoint, как вы это делали, и после того, как вы щелкнете правой кнопкой мыши по графику и повторно сгидрируете диаграмму, сохраните его под другим именем и сравните его с вашим автоматическим результатом.