Краткий ответ: Вы не можете.
Более длинный ответ:
Adobe создала технологию «Flash to iPhone», которая позволила разработчикам создавать приложения Flash и экспортировать их в iPhone. Были и другие технологии, такие как Unity, Titanium и MonoTouch, в которых использовались аналогичные подходы, и казалось, что это приемлемый подход к созданию приложений для iPhone. Adobe включила эту технологию во Flash Professional CS5.
Из-за изменений в лицензировании, предусмотренных соглашением разработчика iPhone SDK (пункт 3.3.1), использование такой технологии в настоящее время является нарушением этого соглашения. Впоследствии Adobe объявила, что прекратит всякую разработку своей технологии «Flash to iPhone».
http://www.mikechambers.com/blog/2010/04/20/on-adobe-flash-cs5-and-iphone-applications/
Я предполагаю, что такая технология не будет добавлена в Flash Builder.
По непонятным мне причинам Flash Professional и Flex Framework не работают вместе. Вы не можете использовать Flash Professional для создания приложений Flex. Поэтому не существует известного способа создания приложений Flex для iPhone.
Мы с радостью создадим ваше приложение во Flash Professional без Flex Framework. Неизвестно, как этот пункт будет применяться, если вообще будет применяться. Но с точки зрения бизнеса я бы не рекомендовал это.
Обновление 12/23/2010
С тех пор как это недавно получило поддержку, я хотел уточнить, что после моего первоначального ответа Apple изменила свое лицензионное соглашение, разрешив использовать сторонние инструменты, такие как Adobe iPhone Exporter. Adobe возобновила разработку проекта, и ожидается, что он появится в Flash Builder в будущем. Многие, в том числе и я, надеются, что он попадет в релиз Burrito, который, как полагают, будет Flex и Flash Builder 4.5. Ожидается, что рабочий процесс и набор компонентов будут аналогичны мобильным проектам Burrito; хотя они поддерживают только AIR for Android в инструментах прямо сейчас.
Некоторые говорят, что для развертывания flex на iPhone можно использовать компилятор командной строки .