IMO, вам следует избегать установки этих библиотек в GAC. Избегая GAC, вы значительно упрощаете процесс установки. На самом деле, это может оказаться настолько простым, что вы можете просто скопировать биты с одного компьютера на другой для выполнения установки (хотя у вас могут быть другие ограничения установки, которые могут помешать этому).
Когда вы делаете ссылку на стороннюю библиотеку, вы можете в Visual Studio щелкнуть ссылку и установить для параметра Copy Local значение true. Это скопирует библиотеку в вашу папку bin. Сторонние библиотеки обычно устанавливаются на компьютере разработчика в GAC, но для развертывания вы хотите, чтобы система скопировала библиотеку в папку bin.