Если вы не можете изменить базу данных удаленного сервера, лучшим вариантом может быть создание какой-либо хеш-функции для значений данной строки, сравнение старой и новой таблиц и извлечение только тех, где функция (oldrow)! = функция (newrow).
Вы также можете просто выполнить прямое сравнение рассматриваемых столбцов и скопировать эту запись, если не все рассматриваемые столбцы совпадают между старым и новым.
Это означает, что вы не можете изменять значения в новой таблице, иначе они будут ежедневно перезаписываться из старой. Если это проблема, вам понадобится другая таблица, в которой будут кэшироваться значения старой таблицы за день до этого; тогда вы сможете определить, были ли старые, новые или оба были изменены за это время.