Непонятно, если вы имеете в виду файл codebehind .aspx.cs или отдельный файл класса .cs.
В основной папке не должно быть файлов .cs. Он должен находиться в папке app_code (или в библиотеке классов, если вы выполняли WAP).
Ваши файлы .aspx.cs связаны с вашим файлом .aspx. Я бы не рекомендовал пытаться убрать эти файлы, если это то, что вы пытаетесь сделать.
Пространство имен верхнего уровня, содержащее _Default или любой код, который, как представляется, не имеет пространства имен, - это ASP. Обычно это скрыто в Visual Studio. Таким образом, его настоящее имя ASP._Default