Вот пример, если вы создали таблицу, в которую хотите переместиться, с описательными именами:
>>> import MySQLdb
>>> conn = MySQLdb.connect(user='username', db='dbname')
>>> cur = conn.cursor()
>>> cur.execute('select files from old_table where conditions=met')
>>> a = cur.fetchall()
>>> for item in a:
... cur.execute('update new_table set new_field = %s' % item) # `item` should be tuple with one value, else use "(item,)" with comma