Если подумать, как насчет размещения FlexPaperViewer.swf в папке public / intels?
Таким образом, структура каталогов будет
<project-directory>/public/intels/FlexPaperViewer.swf
Это сделает ссылку правильной. Кажется, так проще сделать.
Надеюсь, это поможет.
EDIT
Другой альтернативой будет посмотреть, как была сгенерирована ссылка, возможно, есть параметр, который вы можете установить при встраивании FlexPaper.
Мне не известны какие-либо изменения маршрута, которые могут делать то, что вы хотите. Может быть, кто-то еще может помочь в этом.