Независимо от того, является ли это скриптом, html-файлом (например, для фрейма), css-файлом, изображением, чем угодно, если вы не указываете сервер / домен, путь к html-документу будет по умолчанию, так что вы можете сделать, например,
<script type=text/javascript src='/dir/jsfile.js'></script>
или
<script type=text/javascript src='../../scripts/jsfile.js'></script>
Если вы не предоставите сервер / домен, путь будет указываться относительно пути к странице или сценария пути основного документа