Если вас беспокоит производительность, вы можете быть уверены, что операция выполняется довольно быстро, даже если она выполняется для каждой вставленной строки отдельно. Но если вы действительно думаете, что это приведет к проблемам с производительностью, вам следует профилировать.
Единственная альтернатива, о которой я могу подумать, это сбросить триггер, выполнить запрос вставки и повторно добавить триггер, что на самом деле является ужасным решением (к сожалению, вы не можете отключить триггеры для сеанса в mysql - на самом деле вы не можете отключить их на все).