Вы можете настроить поток вывода ошибок следующим образом:
errorOutputStream = new java.io.ByteArrayOutputStream();
errorPrintWriter = new java.io.PrintWriter(errorOutputStream, true); //second param enables autoflush so you don't have to manually flush the printWriter
tidy.setErrout(errorPrintWriter);
Тогда, когда вам нужно увидеть ошибки errorOutputStream.toString();