Если при создании ваших видеоклипов вы храните их в массиве, например:
var clipStore:Array = [ ];
for (var i:int=0; i < numClips; i++){
var clip:MovieClip = new MovieClip();
clipStore.push(clip);
}
позже, когда вы удалите один из объектов, а также его ссылку в массиве, вы можете использовать массив для циклического перемещения по элементам и обновления позиции каждого из них.
var clipStoreLength:int = clipStore.length;
for (var i:int=0; i < clipStoreLength; i++){
MovieClip(clipStoreLength[i]).y = i * (clipHeight + span);
}