Цитировать проблемы с bash - это весело.
$ cat input
"This is an \"input file\" that has quoting issues."
$ sed -e 's/\\"/'"'"'/g' input
"This is an 'input file' that has quoting issues."
Обратите внимание, что есть три строки, соединенные вместе для создания сценария sed:
Первые и последние заключаются в одинарные кавычки, а середина - в двойные.
Команда Мэтью работает, соединяя две строки вместо трех:
где первый в одинарных кавычках, а второй в двойных кавычках.