Inode - это * nix представление файлов на диске. Они идентифицируются по номеру, а не по пути, в котором они находятся в структуре каталогов. Таким образом, ограничение распространяется на всю файловую систему, независимо от того, какая жесткая ссылка (и) (запись файла, которую вы видите в каталоге) указывают на индекс (inode).