У вас есть 1 весенний контекст, и поэтому вы не можете иметь бины, невидимые друг для друга.Тем не менее, вы можете поместить разные bean-компоненты с разными идентификаторами в разные xmls, используя:
в web.xml:
<context-param>
<param-name>contextConfigLocation</param-name>
<param-value>/WEB-INF/flow1.xml,/WEB-INF/flow2.xml</param-value>
</context-param>
или в applicationContext.xml (ваш файл flowX.xmlв / WEB-INF / classes - то есть в корне пути к классам):
<import resource="classpath*:/flow1.xml" />
<import resource="classpath*:/flow2.xml" />