Ты не можешь этого сделать, ИМХО.
Беда в том, что эти методы на самом деле не "существуют"; Они «создаются на лету» с помощью method_missing
хуков, при первом их вызове, во время выполнения.
Другие системы генерации документации имеют способы объявления "неявных" методов. Например, NaturalDocs имеет ключевое слово function , которое позволяет создавать функции, которые существуют только в комментариях. Я недостаточно знаком с YARD, но, похоже, у него нет схожей функциональности.
Удачи!