Как правило, если вы видите проблему с аутентификацией, когда она работает в IE 6, но не в IE 7, я проверю, чтобы убедиться, что Kerberos настроен правильно.
При работе в качестве сетевой службы ваши SPN Kerberos должны быть привязаны к учетной записи компьютера. В качестве учетной записи домена имена SPN должны быть включены в эту учетную запись.
Относительно того, почему IE 6 отличается от IE 7, скорее всего, это связано с некоторыми исправлениями Kerberos, которые применяются к CNames и тайм-аутам билетов. Поиск MS Поддержка "Kerberos HotFix"
Чтобы отключить Kerberos для сайта:
cscript adsutil.vbs set w3svc / ### / NTAuthenticationProviders "NTLM"
Где ### - это SiteID из MetaBase.