Что касается FxCop, да, это хорошая идея - использовать инструмент независимо от того, находитесь ли вы в новом проекте или уже существующем. Как и StyleCop, вы можете запустить инструмент и просмотреть вывод. В отличие от StyleCop, FxCop работает с скомпилированным кодом, а не с исходным кодом.
Сначала это будет ошеломительно. Хорошей идеей является отключение всех групп правил и повторный запуск инструмента, чтобы получить чистый лист. Включите по одной группе за раз, разрешив любые сообщения, которые появляются, или отключив определенные правила в этой группе, если они не применяются к вам (правила по умолчанию в целом довольно широки, и не все будут применяться; вам нужно настроить набор правил для ваших нужд).
В конце вы разрешите все сообщения, либо применив соответствующие исправления, либо выборочно отключив посторонние правила.
Как правило (не каламбур), я считаю, что группы безопасности и производительности хороши для начала. Правила именования являются субъективными и могут противоречить вашим собственным соглашениям. Выключите их, если так. Мобильность и глобализация также субъективны и зависят от ваших потребностей. Что касается всего остального, ну, вы сами создаете свои выводы!