Предположительно, эти документы не обязательно должны быть постоянно онлайн. Если это так, то из предоставленной вами информации я не вижу причин, по которым вам нужно было бы изменить рабочий процесс.
PNG - широко поддерживаемый формат со сжатием без потерь (zlib), который, я полагаю, вы используете. Если вам не нужно сжатие без потерь, хороший JPEG-файл обеспечит более плотное сжатие за счет незначительной потери качества, если вы настроите соотношения сжатия соответствующим образом. JPEG2000 может быть другой альтернативой, в зависимости от вашего программного стека. TIFF со сжатием LZW не предлагает никаких существенных преимуществ перед PNG, кроме поддержки 16 бит на пиксель, которая вам, вероятно, не нужна. Другие варианты включают фирменные специальные кодеки (такие как MrSID), которые предлагают чрезвычайно хорошее сжатие чрезвычайно больших файлов по цене.
Поскольку это отсканированные документы, я думаю, что я думаю о PDF как о "естественном" формате для их кодирования. PDF предлагает различные варианты сжатия в зависимости от содержимого файлов. Но я бы не пошел на все, чтобы починить то, что не сломано.
Если вы думаете о том, сколько вы сейчас тратите на дисковое пространство, 1,5 ГБ в день - ничто. Место на диске дешево и постоянно дешевеет. Просто покупайте три новых USB-накопителя емкостью 1 ТБ (основное / резервное / внешнее резервное копирование) каждые 6 месяцев на общую сумму 240 долларов или что-либо еще. Даже резервное копирование на ленту не является необоснованным.