Два варианта:
Запустите приложение Java с перенаправленным stdout
java com.example.MyApp > out.txt
Используйте взамен jstack
.
Утилита jstack позволяет получить дамп потока и отправить вывод на текущую консоль вместо стандартного вывода Java-приложения, что позволяет вам перенаправить его.
Например, если PID вашего Java-приложения 12345 (используйте утилиту jps , чтобы быстро найти его):
jstack 12345 > threads.txt